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異硫氰酸熒光素（FITC）是熒光素的一種衍生物，廣泛應(yīng)用于流式細(xì)胞儀等領(lǐng)域。FITC 是原始熒光素分子的功能化異硫氰酸酯活性基團(tuán)（-N=C=S），取代了結(jié)構(gòu)底環(huán)上的一個(gè)氫原子。這種衍生物對(duì)親核物具有反應(yīng)性，包括蛋白質(zhì)上的胺和巰基。
琥珀酰亞胺酯官能團(tuán)連接到熒光素核心，形成 "NHS-熒光素"，形成另一種常見(jiàn)的胺反應(yīng)衍生物，在其他親核劑存在的情況下，對(duì)伯胺具有更強(qiáng)的特異性。
FITC 的激發(fā)和發(fā)射光譜峰值波長(zhǎng)約為 495 納米/519 納米，因此呈綠色。與大多數(shù)熒光染料一樣，它容易發(fā)生光漂白。由于存在光漂白問(wèn)題，熒光素的衍生物（如 Alexa 488 和 DyLight 488）已被定制用于需要更高光穩(wěn)定性、更高熒光強(qiáng)度或不同附著基團(tuán)的各種化學(xué)和生物應(yīng)用。